杭州市凤栖幼儿园有凤栖园区和刀茅园区2个园区。凤栖园区位于刀茅巷131号，刀茅园区位于下城区刀茅巷建德村78号。

杭州市凤栖幼儿园前身是刀茅巷幼儿园，2003年2月，为了满足群众对优质教育的需求，原下城区人民政府办公室发文同意区教育局成立“杭州凤栖幼儿园”，即原下城区中大•凤栖公寓配套幼儿园，办学体制为国有民办，招收托班幼儿。2008年9月，为推进集团化办学，原下城区教育局撤销杭州凤栖幼儿园并整体并入杭州市东园婴幼园，成为东园婴幼园的一个园区（凤栖园区）。2013年8月，为满足周边入园需求，通过“校改园”增设刀茅园区。2015年8月，从东园婴幼园脱离，成为独立法人性质的公办幼儿园，即“杭州市凤栖幼儿园”成立。